Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms