Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
U2af1Q9D883 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms