Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms