Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms