Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capns2Q9D7J7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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