Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf225Q9D7D1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms