Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms