Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tube1Q9D6T1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms