Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms