Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms