Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms