Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 585.4 ms