Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gcc1Q9D4H2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms