Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sohlh2Q9D489 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms