Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx29Q9D3S3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms