Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D3J9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms