Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms