Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Snx20Q9D2Y5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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