Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700034E13RikQ9D2T6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700034E13RikQ9D2T6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700034E13RikQ9D2T6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
1700034E13RikQ9D2T6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700034E13RikQ9D2T6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
1700034E13RikQ9D2T6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
1700034E13RikQ9D2T6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700034E13RikQ9D2T6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms