Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D2Q3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms