Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms