Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms