Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2cQ9D1C1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms