Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms