Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms