Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms