Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mms19Q9D071 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mms19Q9D071 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms