Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf146Q9CZW6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms