Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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