Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Mrpl55Q9CZ83 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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