Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp2Q9CYZ8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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