Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssu72Q9CY97 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms