Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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