Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf1Q9CWX2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms