Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms