Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms