Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms