Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sycp2Q9CUU3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms