Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930519P11RikQ9CUJ8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms