Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms