Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d3Q9CSV6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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