Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rprd1bQ9CSU0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms