Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ska2Q9CR46 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska2Q9CR46 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms