Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifitm3Q9CQW9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ifitm3Q9CQW9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifitm3Q9CQW9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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