Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ykt6Q9CQW1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ykt6Q9CQW1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Ykt6Q9CQW1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Ykt6Q9CQW1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ykt6Q9CQW1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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