Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms