Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms