Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp6v0e1Q9CQD8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp6v0e1Q9CQD8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atp6v0e1Q9CQD8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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