Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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