Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921530L21RikQ9CQ47 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921530L21RikQ9CQ47 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921530L21RikQ9CQ47 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921530L21RikQ9CQ47 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms